Al general se le acusa de la detención ilegal y desaparición de Rosendo Radilla Pacheco, ocurrida en 1974, en el municipio de Atoyac de Álvarez, época en la que Quirós Hermosillo fungía como mando de la llamada "Brigada Blanca", conformada por elementos de distintas corporaciones que realizaban los operativos contra presuntos activistas e integrantes de la guerrilla.

La Fiscalía Especial para Movimientos Sociales y Políticos del Pasado (Femospp) consignó el jueves el expediente en contra de Quirós Hermosillo, y el Juzgado Segundo de Distrito en Materia de Procesos Penales Federales con sede en el estado de Guerrero, consideró que existían suficientes elementos de prueba para ordenar la aprehensión del militar.

El general fue notificado por el Ministerio Público de la Federación del nuevo cargo en su contra, en la prisión del Campo Militar Número Uno, donde se encuentra purgando una condena por sus nexos con el cártel de Juárez.

Desde octubre de 2002, la Procuraduría de Justicia Militar inició una investigación contra Quirós Hermosillo y el general Arturo Acosta Chaparro, por la desaparición de 143 personas en el estado de Guerrero, en los llamados "vuelos de la muerte", en los que presuntamente los detenidos eran arrojados al mar.

Sin embargo, hasta la fecha no se ha emitido una resolución de los jueces castrenses sobre la presunta responsabilidad de ambos militares sobre la desaparición forzada de más de un centenar de personas.

En la vía civil, la Femospp ha realizado sus propias investigaciones sobre la probable responsabilidad de los mandos militares en operaciones ilegales para eliminar a los activistas e integrantes de la guerrilla durante la década de los 70, que derivaron en la consignación de uno de los expedientes contra Quirós Hermosillo.